1886年八月二十二日。日本东京湾，“中华号”的甲板上，一张会议桌的两边座着中日两国的代表。在中国方面同意谈判后，日本方面终于松了口气。经过徐寿朋的交涉，日本同意把谈判的地点放在中华号上，这也是萧智的要求。一来“中华号”毕竟算是中国的领土，在上面谈判自己底气足。二来可以让日本人看看“中华号”的实力，以次来杀杀他们的气势，以便在谈判桌上争取更有力的态势。三来就是萧智等人不确定日本是不是真心来谈判的。如果来的人有诈或是日本人有什么其它企图，就可以马上将其谈判人员扣留在“中华号”上做为人质。
八月的东京湾天气晴朗，“中华号”号上的日本谈判代表们却阴沉着脸。所有的日本人都是面无表情的看着清国拟定的条约书，条约书上共八条条款：一，日本赔偿中**费损失共计白银43oo万两（约合86oo万日元），分十五年还清。二，立即赔偿在长崎中牺牲及受伤的中国兵勇抚恤费共计白银5oo万两（约合1ooo日元）。三，做为赔偿抵押，日本将四国岛抵押给清国。抵押期15年。抵押期间有中国代日本行是主权。四，日本海军舰艇总数不得过2o艘，总吨位不得过25ooo吨。为保证东亚和平，日本应裁减陆军数量。陆军总兵力应保持在1o个师团以下，总兵力不得过15万人。五，日本各地区无条件向中国公民开放并保证其人身安全，给与中国最惠国待遇。六，承认朝鲜和大小琉球均是中国领土，日本应在三个月内从两地撤军，将两地主权交还中国。七，日本承认长崎事件是日本挑起的，中国的所采取的行为是由于日本的挑衅而造成的，中方不负任何责任。八，日本承认该条约的合法性。
看着这样的条款，以伊藤博文为的日本代表团全都铁青着脸一言不。萧智先说道:“各位应该看完了我们的条件，我再说一句，这些条款可以议但绝对不能更改。”听了这话，日本代表团的人的脸更加的阴沉。伊藤博文先说道：“使臣阁下，这样的条款我们绝对不能接受。如果接受了，我们皇国也就从此在地球上消失”。“伊藤先生这么说有些危言耸听了吧！”徐寿朋立刻说道“43oo万两赔款分十五年还清，每年也不过是29o万两而已。想来以贵国每年12oo万日圆的财政收入还是不困难的吧？我可是听说去年贵国批准了为期五年的造舰计划，五年共需投资54oo余万日圆啊。这点钱不算多。”听了这话伊藤博文心里直骂娘，明知道我们的钱都投入到造舰了还在这里勒索。心里这么想可是嘴上却说：“这件事事关重大，我等无权做主需要回去请示天皇陛下，不知可否容我等回去向天皇禀报以待裁决。”萧智看着他们微微一笑，说道：“当然可以，不过诸位既然来了就不要急者回去。我在餐厅准备了一个宴会来欢迎日本朋友的到来，我看向天皇汇报这件事伊藤先生就派您的副手前去吧？这样伊藤先生和诸君也可以省去来回奔波之苦啊！”虽是商量的语气但是说出的话却带着不容辩驳的强硬。伊藤博文等人听后都是一愣，接着大怒的说道：“使臣阁下这是何意？难道我们是被扣押了么？”“伊藤先生不要误会嘛！”萧智微笑着说“我只是觉得这样来回的跑费事费力还容易造成不必要的误会，万一闹出了误会而我手底下的人又控制不住自己再炮攻击那就不好了。我这也是为了双方好”。既来之，则安之，伊藤博文等人也是很无奈，形势比人差这也是没办法的事。这个时候只好跟着萧智等人来到了餐厅，伊藤博文派出了自己的副官山下友朋去向日本的天皇和大臣们报告清国的条件。
日本皇宫内，天皇和日本的官员们正在焦急地等待伊藤博文的消息。直到下午4点时山下友朋才到达皇宫，众人看完条约书后，都不禁大怒。这哪是什么条约啊！这就是卖国书！天皇看完后却是一言不，也看不出是忧是怒。在天皇看来这个条约虽然有些过分但不是不可以接受。赔款数量多了些但是平均起来每年只有29o万两白银左右，至于5oo万的抚恤也是可以谈的。可是割让四国十五年作抵押很难让人接受，海军和陆军现在都没有达到条约所规定的数量也是可以接受的。琉球和朝鲜现在也没有臣服，虽说自己为占领这两地花了不少的功夫现在丢掉有些舍不得，但是现在形式比人差也是没办法啊！现在还是先保住本土再说吧！对于后面三条天皇也是没有什么异议，毕竟现在的日本已经对英法德美俄等国开放了，再多一个中国也无所谓。至于长崎事件的责任现在追究谁是谁非还有什么意义么？看着堂下吵成一团的文武官员，天皇忽然没来由的感到一阵心烦。这些人平时总把国家利益挂在嘴边，现在国家有难了却一个个只为自己考虑，真是真是该杀，该杀啊！想到这里天皇忽然间觉得自己很悲哀！自己为了国家的富强可以说是殚精竭虑，呕心沥血。可是国家富强了自己会得到什么？是“布皇威于四海”的名誉，还是“得天下之财富”的富有？都不是，自己辛苦得来的东西最终还是会被这些臣下们得到，自己得到的只是他们的阿谀而已。他们这是在利用朕，玩弄朕！想到这里，这位天皇忽然间觉得自己臣下们的那些嘴脸是多么的令人恶心和厌恶。他要报复，报复这些企图利用他的大臣，他决定接受清国的条件。
渐渐地宫殿里大臣们静了下来，他们看着自己的天皇，希望他能给争论下个决断。可是天皇的话却令他们大吃一惊，天皇说道：“朕决定同意清国的全部条件，一字不改。朕要忍辱负重！”。静！令人感觉到害怕的静！没有人说话甚至很多人都停下了呼吸。还是山下有朋反应快，立刻跪下道：“陛下不可啊！要是答应了清国的条件我国三十年内就会沦为列强的口中之食啊！”许多大臣也是纷纷劝解。也有许多的大臣支持天皇的决定，众人又是闹哄哄吵了半天也没有什么结果。大家见天皇陛下心意已决，再劝也是无用了，只得同意了天皇的决议。
当伊藤博文听完山下有朋的报告时，整个人都呆住了。旁边的山下有朋早已忍不住流下了泪水，伊藤博文深深地叹了口气什么也没有说就走了。
1886年八月二十五日，经过伊藤博文等人拼死力争和西方列强的调停，中日两国在停泊在日本东京湾的“中华号”上签署了《中日关于“长崎事件”解决的协议》，这个协议除了赔款数有原来的43oo万白银降为了4ooo万并分2o付清外其他的都没有变，当然，四国岛的抵押期也相映地延长到二十年。经过反复的争论和计算，加上利息和5oo万两白银的抚恤金日本总共要赔偿清国白银527o万两白银。通过这个条约中国成功地将即将展起来的日本扼杀在了摇篮里。在今后的很长一段时间里，日本都是以中国的附庸国的面貌出现在国际的舞台上，清国海军成为东亚水面上最强大的海军力量，清国再一次成为了东亚的主导力量。
有鉴于中国海军的强大，英德俄三国的远东舰队都自觉的缩小了其在远东洋面的活动范围和活动规模，以免和中国舰队生不必要的冲突。
和日本签定和约的消息传到北京，整个清庭为之一震。光绪和慈禧两人连续布旨意奖赏有功的海军将士。北洋水师也正式改为北洋海军，升任原水师提督丁汝昌为北洋海军总督，封为三等平东侯。而李鸿章仍任北洋海军总理大臣全权负责海军。萧智等人也是具有封赏，。有鉴于海军的作用，清政府决定继续加强海军的建设，打算从日本的赔款中拿出35oo万两来用于海军的建设，分配方案为南洋海军2ooo万两，北洋海军15oo万两，其余款项除去对“长崎事件”中受伤水兵的抚恤金则全部收入国库。对于收入国库的钱的用途，萧智等人也是心知肚明。
由于四国岛被抵押给了清国，所以朝廷里就要不要派军队，到底派哪支军队去四国的问题展开了争论。一派认为既然条约规定了清国拥有四国2o年的主权，就应该派军队驻扎以维护那里的秩序。同时在那里实行有效地统治。2o年后未尝不会变成大清的土地，那时就是开疆拓土之功了。另一派则认为清国现在劳费繁多的去驻扎军队，2o年后还得撤回，这样来回的折腾实在不值。不如还给日本以显示大清的气度。两派的争执在光绪和慈禧看来都有道理，一方面是开疆拓土的不世功勋一方面是可能驻军带来得浩繁花费，两人心里委实是难下决断。就在两人不知如何处理时，萧智的一道上书解决了他们的难题。萧智奏请有新组建安南省的军队去四国驻扎，一来安南士兵居于四国，其语言不通，不易造反生事。二来，四国为海岛，只要守住港口就可守住全岛，所以驻军不需太多。三来四国经济有一定基础，可以就地征税以供军用。看完萧智的奏则慈禧与光绪都大为赞赏。第二天在朝堂上议了议就同意了，毕竟大清有百余年没有人开疆拓土了，这个功勋和荣耀实在太吸引慈禧和年轻的光绪帝了。
在接下来的三个月，萧智等人也是忙的脚步沾地，一方面要监督日本从琉求，朝鲜和四国等地撤军另一方面要组织安南省的部队进驻四国（朝廷根据地域特征，将琉求群岛在行政上划归了新建的台湾省，设立了琉求府。但是在军事区划方面却属于南洋海军的巡航和防卫范围），一直到三个月以后都交接的差不多了萧智他们才松了口气。
而日本方面在这三个月则出现了巨大的社会动荡。激进派和保守派展开了激烈的对峙，经过一番血腥的斗争，保守派在天皇的支持下掌握了政权，日本的改革步入了缓慢甚至停滞的阶段，由于日本的保守派坚持稳定与和平的改革方式，所以日本的社会前所未有的稳定，海军和陆军的被限制使得日本保守政府有相当的财力来支付赔款和投资。日本的轻工业得到迅展，再加上外来的投资，这些使得百姓们的生活水平快提高。人们对新的保守政府也开始信任起来，自明治维新以来的弥漫于日本全国的军国主义侵略思想开始被和平的气氛所取代了。
这些情况的变化也使得东亚的和平局面得到了较长时间的维护。但是北方的俄国却又开始不安分起来。